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小麦赤霉病是一种世界性的流行病害,在我国的危害范围也越来越大.在黑龙江、呼伦贝尔、吉林、沈阳、通辽、河南等地区小麦种植区采集小麦赤霉病的病穗,经组织分离法分离病原菌,单孢纯化后获得镰孢菌90株.通过病原菌传统形态学鉴定和EF-1α序列分析,90株镰孢菌鉴定为6个种：禾谷镰孢菌Fusarium graminearum为优势种,有47株,约占52.2％；藤仓镰孢菌Fusarium fujikuroi有15株,约占16.7％；木贼镰孢菌Fusarium equisetum、接骨木镰孢菌Fusarium elderberry、轮枝镰孢菌Fusarium verticillium、层生镰孢菌Fusariu proliferatum为弱势种,分别占11.1％、11.1％、5.5％、3.3％.