Cytochrome c oxidase subunit Ⅲ (COX3) gene,an informative marker for phylogenetic analysis and diffe

来源 :中国畜牧兽医学会家畜寄生虫学分会第七次代表大会暨第十二次学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hhtui
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  In this study a 552:bp region of the Cytochrome c oxidase subunit Ⅲ (COX3) was amplified by polymerase chain reaction (PCR) and sequenced from individual Babesia species.Sequence variation between Babesia species from China ranged between 0-32.4%.We analyzed the phylogenetic performance of the partial sequence of the COX3 gene to resolve Babesia relationships as compared to the nuclear 18S rRNA and the mito chondrial cytochrome b (COB) gene,These data indicate that the COX3 gene seems to be superior to the COB gene and the 18S rRNA in recognizing closelineages among some Babesia species.Our work indicates that the COX3 gene does complement and corroborate the phylogenetic inferences observed with the nuclear 18S rRNA and the COB gene previously reported.The combined phylogenetie analysis based on the nuclear 18S rRNA and the COX3 gene significantly improved (bootstrap) intraspecies support of the phylogenetic relationship.The presence of additional variable sites in the COX3 gene allowed an improved interspecies differentiation of Bab esia species in this study.The data could be applicable for the survey of parasite dynamics,epidemiological studies as well as prevention and control of the disease.
其他文献
为了给青藏高原家畜、家禽寄生虫病防治提供依据,2008年至2012年,针对青海省不同海拔高度、气候条件、地理环境等特点,采用现场调查、寄生虫完全剖检法、血清学调查等方法在海晏、互助、达日、化隆、德令哈、治多、泽库、贵南、祁连和共和10县(市)进行了牛、羊、猪、鸡和犬寄生虫的区系调查工作,并在海晏、达日、化隆、德令哈、治多、泽库、贵南7县(市)开展了牛羊寄生虫季节动态研究,共剖检羊252只、牛210
为研究少孢节丛孢菌口服生物制剂的安全性,将感染捻转血矛线虫后的20只6月龄绵羊分成4组,前3组分别灌服含有1.0×105、1.0×106、1.0×107少孢节丛孢菌分生孢子口服生物制剂,第4组为对照组灌服灭菌的生理盐水,灌服后连续30d观察绵羊的精神状态、食欲、饮水、体温、粪便、增重等临床指标;并在7d后每组分别剖检2只绵羊,无菌采集肝脏、脾脏、肾脏、肠道淋巴结等组织器官,进行组织切片和少孢节丛孢
为研究捕食线虫性真菌产生的胞外蛋白质的生化性质及其相关杀虫作用,首先应用线虫作诱导剂和液体培养基,发酵培养捕食线虫性真菌,对产生的发酵液经浓缩处理后,测定其中的酶活性并进行杀虫试验;而且对发酵液进行层析纯化,再进行PH、温度、蛋白酶抑制剂试验.结果显示,培养基的组成成分和相关诱导剂能够显著影响捕食线虫性真菌的代谢发酵过程,其发酵液中蛋白酶和磷酸酶活性及杀虫作用显著不同,其中动物寄生性线虫诱导的枸椽
目前有关我国牛群感染比氏肠微孢子虫的报道很少,为了解我国部分地区牛群感染比氏肠微孢子虫的分子特征,于2012年在河南(新乡,洛阳),山东济南和湖南岳阳等地采集了446份奶牛,166份肉牛和65份水牛粪便样品,采用巢式PCR方法扩增核糖体RNA内转录间隔区ITS序列,分别检测出22(4.9%),9(5.4%),1(1.5%)份阳性样品,平均感染率为4.7%(32/677).对32份阳性样品进行测序,
采用饱和盐水漂浮法,对荣昌县的昌元、盘龙、荣隆、观胜、双河、清升等6个乡镇的9个兔场进行了兔球虫病的流行病学调查及虫种鉴定.结果显示:9个兔场均为球虫阳性;球虫阳性率最高的场为 100%,最低的为26.52%,平均感染率为76.94%;幼兔感染率为85.55%,青年兔感染率为65.38%,种兔感染率为30.93%.9个兔场的球虫共鉴定了12种艾美耳球虫,即:斯氏艾美耳球虫(检出率l3%)、大型艾美
为掌握裕民县全县范围家/牧犬细粒棘球绦虫感染情况以及家畜包虫病感染情况,掌握该县家/牧犬服用吡喹酮后干预效果.2009年至2012年间对裕民县的家/牧犬进行细粒棘球绦虫感染调查,2011-2012年在屠宰场直接检查牛羊肝脏和肺脏的棘球蚴,进行计数、登记.在农/牧区入户对广大居民进行包虫病危害和防控知识问卷调查.通过入户落实和了解家/牧犬服用驱虫药情况,以及对村民包虫病防病知识进行询问,广大居民的预
本实验旨在研究Hc-rps30基因的结构和功能,分析其在捻转血矛线虫滞育过程中的作用机制.按照Gibbs(1971)的方法获得滞育虫体,Real-time检测正常虫体与滞育虫体中Hc-rps30基因的转录水平;RACE、Genome walking等技术获得全基因序列及完整cDNA序列;饲喂法RNAi和显微注射分析秀丽隐杆线虫中rps30基因沉默及过表达对虫体表型的影响;显微注射及脂质体转染分析H
为了解新疆察布查尔县家畜包虫病的流行现状和家/牧犬细粒棘球绦虫感染情况方法2011-2013年在该县家畜定点屠宰场对剖检牛、羊进行肝肺感染棘球蚴(包虫)情况调查,用双抗夹心ELISA方法检测家/牧犬粪抗原的细粒棘球绦虫感染情况结果2011年犬细粒棘球绦虫感染率为8.75%(21/240);2012年犬细粒棘球绦虫感染率4.58%(11/240),家畜棘球蚴感染率11.0%(33/300);2013
为探讨四川地区多头带绦虫的种群遗传多样性和系统发生关系,本研究分析了20株四川山羊源多头蚴的线粒体cox1基因和Cytb基因全序列.结果显示:多头蚴cox1和Cyt6基因全序列长度分别为l623 bp和1068bp,分别有59个和9个变异位点,其碱基变异率分别为0.1%~2.5%和0.1%~0.7%;分别检测到17个和6个单倍型,总的单倍型多样性分别为0.968±0.033和0.737±0.068
The heat shock protein 20 (hsp20) gene of Babesia orientalis (BoHSP20) was obtained from both genomic DNA and cDNA.The nucleotide sequence of BoHSP20 was 690 bp with an open reading frame (ORF) of 534