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小麦白粉病是由布氏白粉菌小麦专化型(Blumeria graminisf.sp.tritici)引起的世界性小麦病害.本研究应用ISSR分子标记检测了我国部分麦区小麦白粉菌的遗传多样性及不同地区菌株间的亲缘关系.在50个ISSR引物中，筛选出6个引物对采自我国四川、北京、河北和甘肃4省(市)的134个单孢分离菌系进行了PCR扩增，共得到93个ISSR位点，其中多态性位点56个，占60.22％.利用NTsys-2.10e软件中的UPGMA算法构建了我国小麦白粉菌的亲缘关系树状图，聚类分析结果表明我国小麦白粉菌的遗传多样性与病原菌的地理来源有一定的相关性.用PopGene32软件计算了我国小麦白粉菌群体内和群体间的遗传多样性参数，结果表明：各省市群体内菌株存在着高度的遗传分化，而4个省市间小麦白粉菌的遗传差异程度不高，不同地区群体间分化并不明显，地区间菌源可能存在着传播与交流.