【摘 要】
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<正>肠道微生物组在人类健康和疾病中的作用已经被广泛接受,而菌群产生的代谢产物是其发挥主要作用的方式。我们课题组主要利用新的方法和技术进行微生物组的功能和利用研究。一方面,现有的微生物组分析主要借助成熟的二代测序技术,在分析深度上逐渐接近瓶颈。我们利用最新的三代(纳米孔)测序技术在人群中进行了宏基因组的拼接和深度分析,拓展了宏基因组的范畴以涵盖结构变异(structural variations)
【出 处】
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第四届中国生物物理学会代谢生物学分会学术研讨会摘要集
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<正>肠道微生物组在人类健康和疾病中的作用已经被广泛接受,而菌群产生的代谢产物是其发挥主要作用的方式。我们课题组主要利用新的方法和技术进行微生物组的功能和利用研究。一方面,现有的微生物组分析主要借助成熟的二代测序技术,在分析深度上逐渐接近瓶颈。我们利用最新的三代(纳米孔)测序技术在人群中进行了宏基因组的拼接和深度分析,拓展了宏基因组的范畴以涵盖结构变异(structural variations)和甲基化修饰(methylation modification),并且发现这些变异能够在菌株水平以及不同时间点影响代谢产物组成,最终影响宿主健康。另一方面,除了小分子代谢产物,菌群所产生的小肽类物质也在我们研究中逐渐凸显其重要性,在多种疾病中具有致病或者治疗作用;在此基础上我们结合人工智能方法进行了深度的挖掘,以抗菌肽为例展示了人工智能方法挖掘一系列微生物代谢的小肽能够作为治疗性的分子,并对未来功能分子挖掘/药物研发具有重要的启示。
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