各国农业生态学研究在近年取得了长足进展，主要发展可以概括为(1)继续开展生态农业、有机农业等可持续的替代农业研究，(2)积极探讨在农业中保护和利用生物多样性，(3)为应对全球变化的低碳农业、循环农业，以及全球变化与农业的关系成为研究热点，(4)农业生态的景观研究也逐步得到重视，(5)与社会经济法规和政策相结合的农业生态学研究也有所增加。通过中外有关研究的比较可以发现，发达国家发起和引领农业生态学研究潮流的思维活跃，模拟模型和数学方法运用比较多，长期定位研究起步早。我国农业生态学研究则在揭示传统特色农业的生态学机制，解决中国特殊区域的农业生态研究方面相当突出。文章最后对农业生态学受到生态学泛化影响的挑战，以及面临我国农业生态问题的挑战进行了讨论，并就这些挑战对农业生态学研究方向产生的影响进行了探讨。