【摘 要】
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目的:配体激活的TLR7信号通路可以启动细胞因子基因转录,并能增加共刺激分子的表达,这些物质可能对传染性疾病的防治有一定作用。本研究目的是建立基于化学特征的TLR7激动剂三维药效团模型。基于化学特征的药效团模型有助于发现和设计新型TLR7激动剂。方法:本研究采用Discovery Studio软件构建TLR7激动剂的药效团模型。选择了5个TLR7激动剂作为训练集,并对训练集分子进行构象分析,每个分
【机 构】
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The Second Affiliated Hospital,Baotou Medical College,Baotou 014010,China
【出 处】
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中国药理学会抗炎免疫药理专业委员会成立30周年纪念大会暨2012年学术年会
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目的:配体激活的TLR7信号通路可以启动细胞因子基因转录,并能增加共刺激分子的表达,这些物质可能对传染性疾病的防治有一定作用。本研究目的是建立基于化学特征的TLR7激动剂三维药效团模型。基于化学特征的药效团模型有助于发现和设计新型TLR7激动剂。方法:本研究采用Discovery Studio软件构建TLR7激动剂的药效团模型。选择了5个TLR7激动剂作为训练集,并对训练集分子进行构象分析,每个分子生成的最大构象数使用默认值255,产生的新构象与最低能量构象间的能量差不大于20kcal/mol。训练集中的分子经过构象分析后被提交到HipHop模块生成药效团模型。本研究选择的化学特征包括氢键给体、氢键受体和疏水中心。同时选择了5个TLR7激动剂作为测试集,对获得的药效团模型的合理性进行评价。结果:将得到的10个得分最高的药效团进行分析,Hypo2对训练集中的化合物分子具有较好的预测能力。结论:本研究首次建立了TLR7激动剂的三维药效团模型Hypo2,通过对训练集和测试集中化合物的预测以及数据库中TLR7激动剂的搜索,验证了该模型的可靠性。该模型的建立将有助于发现新型TLR7激动剂。
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