【摘 要】
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<正>微卫星标记由于其高突变性,是一种解决父权分析和近期(10-100代)遗传变化问题的有效手段。传统的微卫星开发利用特定的探针从文库中富集微卫星片段,新一代测序技术的发展
【机 构】
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生物多样性与生态工程教育部重点实验室北京师范大学生命科学学院;
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<正>微卫星标记由于其高突变性,是一种解决父权分析和近期(10-100代)遗传变化问题的有效手段。传统的微卫星开发利用特定的探针从文库中富集微卫星片段,新一代测序技术的发展提供了更全面有效的手段。利用褐马鸡血液DNA样品,构建了180bp的短片段库。通过然后基于Illumina Hiseq 2000平台,对文库进行双末端(Paired-End)测序,读长为100bp,共产生了50G raw data。通过过滤掉在contig序列两端的SSR序列(距离eontig序列两端小于100bp),共检测出45317个SSR序列。从中随机挑选了118对微卫星序列,利用Batch
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