【摘 要】
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本研究以E.coli DH5α为研究对象,基于Ca2+诱导下E.coli DHSα形成感受态细胞时转录组和蛋白组的分析结果,采用生物信息学在线分析软件对膜蛋白yiaW的理化性质、保守结构域、跨膜区、信号肽、磷酸化位点、糖基化位点及相互作用蛋白拓扑网络进行了预测分析.利用Red同源重组技术构建yiaW基因缺陷型菌株,研究在yiaW基因缺失对Ca2+诱导E.coli DH5α感受态形成的影响.结果表明
【机 构】
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兰州理工大学生命科学与工程学院,兰州,730050;兰州理工大学石油化工学院环境工程系,兰州730050
【出 处】
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第二十次全国环境微生物学学术研讨会
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本研究以E.coli DH5α为研究对象,基于Ca2+诱导下E.coli DHSα形成感受态细胞时转录组和蛋白组的分析结果,采用生物信息学在线分析软件对膜蛋白yiaW的理化性质、保守结构域、跨膜区、信号肽、磷酸化位点、糖基化位点及相互作用蛋白拓扑网络进行了预测分析.利用Red同源重组技术构建yiaW基因缺陷型菌株,研究在yiaW基因缺失对Ca2+诱导E.coli DH5α感受态形成的影响.结果表明yiaW为疏水性蛋白,分子中存在2个跨膜区,不存在信号肽序列,也没有磷酸化位点,yiaW有2个糖基化位点.α-螺旋占57.94％.对其相互作用蛋白的拓扑网络预测发现,yiaW与yiaV蛋白为膜融合蛋白(外排泵组件、信号锚,与物质外排有关),和ycdZ(DUF1097家族内膜蛋白)、nrfA(亚硝酸还原酶)、nrfD(甲酸依赖亚硝酸盐还原酶)蛋白相互作用关系最为密切.突变菌株E.coliDH5α∷ΔyiaW生长状态与野生型相比差异性不显著(p＞0.05),Ca2+处理下突变菌株质粒pET-32a的转化效率为1.37×106CFU/μg,野生型转化效率为1.08×107CFU/μg,差异极显著(p＜0.01).综合以上研究结果,基因yiaW在Ca2+诱导E.coli DH5α感受态细胞形成过程中起到了十分重要的作用,其可能是细胞膜上的Ca2+受体之一.
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