【摘 要】
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抗原表位上的突变使得流感病毒能够对现有疫苗产生抗性,从而在人群中进行反复的季节性传播。对未来病毒株的抗原表位突变分布进行预测,将极大地改进目前对流感的防治能力。以
【机 构】
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同济大学生命科学与技术学院; 中国科学院马普学会计算生物学伙伴研究所; 第四军医大学药学系; 复旦大学生命科学学院; 上海生物信息技术研究中心;
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抗原表位上的突变使得流感病毒能够对现有疫苗产生抗性,从而在人群中进行反复的季节性传播。对未来病毒株的抗原表位突变分布进行预测,将极大地改进目前对流感的防治能力。以过去90年的流感血凝素(HA)序列作为训练数据,我们的计算模型模拟了甲型H1N1抗原表位的动态进化。输入抗原表位序列模板之后,模型能够有效地预测未来的抗原表位突变。模型后续对最近16年的10932条HA序列进行验证,结果也覆盖了超过94%的观测病毒株抗原表位。相似的结果在甲型H3N2序列中得到了验证,从而进一步证明了本文模型的普适性。我们研究的结果表明,尽管流感病毒的突变看似随机,但是基于已有的历史数据,未来抗原表位的突变图谱是能够加以预测的。并且随着将来与流感监控网络的进一步整合,我们的方法在预测季节性病毒抗原性以及提高公共卫生干预上将发挥更大的作用。
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