山羊自驯化以来,经历长期的自然和人工选择后,在基因组上留下了不同的选择印迹,形成了在表型、适应和生产性能等方面显著差异的1000多个山羊品种.基于高通量测序技术及基因分型芯片的发展,在全基因组水平上进行选择信号的检测,不仅能够寻找不同品种的受正向选择作用的候选基因,揭示重要经济性状的遗传机制,还能为研究不同山羊品种在培育过程中的人工选育对不同性状的长期选择过程和影响提供遗传学的证据.随后后基因组时代的到来，研究与品种特异性状相关的遗传突变和基因功能将是今后的研究重点。山羊是世界最重要的家畜品种，为人类提供肉、皮、毛和奶等物质，此外还可以作为动物模型进行医学研究。因此，随着测序技术进一步发展，基因组测序和基因分型成本的降低，开发更高密度的芯片，进一步研究品种间差异的遗传机理和重要性状相关遗传变异，将为山羊的基因组选择育种及在生产中起到重要的作用。