Ⅱ型果糖-1,6-二磷酸醛缩酶(FBA-Ⅱ)是藻类和菌类的糖质新生代谢途径中必不可少的一个调控酶。由于其不存在于人和高等生物中,FBA-Ⅱ被作为一个潜在"安全"新靶标而倍受关注。近年来,以FBA-Ⅱ为靶标的抑制剂研究已经取得了一些进展,但这些抑制剂均为FBP或DHAP类似物,由于其含有高极性的磷酸基团而无法穿透细胞膜,因此,上述已经发现的FBA-Ⅱ抑制剂未能表现出任何活体活性的报道。为此,我们综合运用分子模拟(DOX策略和MD等)、定点突变等技术系统深入研究了FBA-Ⅱ与配体作用的分子机制。根据上述相互作用信息,运用多对接软件交互使用的虚拟筛选策略,合理设计、优化合成了一系列亚纳摩尔级别、具有较高藻体/菌体活性的新型FBA-Ⅱ抑制剂先导化合物。研究成果可望为高效、低毒、具有应用前景的新型抑藻/抗真菌药物的研究工作提供一定的创制思路和前期研发基础。