【摘 要】
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太赫兹波(0.1THz-10THz)与生物分子低频运动(诸如分子骨架的振动、转动以及平动等)具有的能量水平有很大的交界,这些低频运动能在太赫兹光谱中通过明显的光谱吸收峰指认.
【机 构】
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中国科学院重庆绿色智能技术研究院,重庆市北碚区方正大道266号,400714
【出 处】
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第十三届国际凝聚态理论与计算材料学会议(The 13th International Conference on Con
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太赫兹波(0.1THz-10THz)与生物分子低频运动(诸如分子骨架的振动、转动以及平动等)具有的能量水平有很大的交界,这些低频运动能在太赫兹光谱中通过明显的光谱吸收峰指认.不同生物分子或相同生物分子的不同构象,由于其内部弱键和非键等相互作用的不同,太赫兹波谱是不同的.本文通过AMBER12建立全原子生物分子水溶液模拟体系,运用分子动力学模拟和准谐振近似(Quasi-Harmonic Approximation) |1||2|,计算了水溶液中多肽生物分子的太赫兹吸收谱,波谱范围10～40 cm-1.通过研究了不同链长的丙氨酸多肽链(ACE-ALAn-NME,n=5,15,30)、丝氨酸多肽链(ACE-SERn-NME,n=5,15,30)的太赫兹波谱随链长变化的异同(Fig.(a),(b)),发现随着链长的增加,平均吸收峰强度也随着增加.随着肽链长度的变化,大部分吸收峰的位置发生改变,这说明太赫兹谱对链长极为敏感.值得注意的是,3个富丙氨酸肽链在39 cm-1附近都有较强的吸收峰,这对丙氨酸多肽链有着指纹谱的意义,而3个富丝氨酸肽链并没有较一致的吸收峰.另外,我们也研究了丙氨酸多肽Ala15(ACE-ALA15-NME)在线团和螺旋构象下的太赫兹谱(Fig.(c)),在不同构象下,Ala15大部分吸收峰发生改变,这说明太赫兹谱能够识别不同的构象.
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