近几年，有机质谱分析技术在我国迅速地发展，其应用面涉及生命科学、有机化学、生物化学、医药卫生和临床、环境保护化学、食品化学、农业科学、石油化工、公安侦破、军事等各个领域，特别是在生命科学探索、药物开发、毒物分析等研究中起着先导作用。有机质谱主要是将有机分子在真空中用电子轰击，给出不同质荷比的分子碎片，经质量分离器分离后，检测记录获得质荷比与丰度之间关系的质谱图，依据质谱图可获取化合物分子质量及结构信息。质谱法已成为确定化合物结构的重要工具。在有机结构鉴定的四大工具(核磁共振、质谱、红外光谱、紫外光谱)中，质谱具有两大突出的优点:①质谱的灵敏度远远超过其余三种方法，用样量很少；②质谱是唯一可以确定分子式的方法，而分子式对推测结构是至关重要的，因此，质谱是结构分析不可缺少的分析手段。质谱仪根据不同的离子化方式和质量分析器分成多种类型，它可与气相色谱和液相色谱联用，色谱一质谱联用仪结合了两种分析方法的优点，成为复杂有机混合物及天然产物分离、分析、结构鉴定的强有力的工具。有机质谱分析技术的应用，近年来在以下方面发挥了显著的功效。其中包括：生物质谱技术在生命科学研究中的应用；高分辨率气相色谱一高分辨率质谱联用技术在二A}英分析中的应用；质谱在食品中农药残留及兽药残留分析中的应用；质谱在组合化学中的应用。有机质已成为各个领域研究中强有力的工具。