【摘 要】
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对获得的东方百合帝伯(Lilium Oriental hybridsTiber)百合切花茎基端创伤转录组测序(RNA-seq)数据库中细胞分裂素(cytokinin,CTK)信号转导途径的相关基因进行分析,结果表明:(1)有13个Unigenes注释到植物CTK信号转导途径,其中编码CRE1、A-ARR和B-ARR的Unigenes分别有2、5和6个;(2)13个Unigenes均呈现差异表达,大
【机 构】
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仲恺农业工程学院,广东广州510225
【出 处】
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广东省园艺学会第十一届会员大会暨广东园艺产业创新与发展学术研讨会
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对获得的东方百合帝伯(Lilium Oriental hybridsTiber)百合切花茎基端创伤转录组测序(RNA-seq)数据库中细胞分裂素(cytokinin,CTK)信号转导途径的相关基因进行分析,结果表明:(1)有13个Unigenes注释到植物CTK信号转导途径,其中编码CRE1、A-ARR和B-ARR的Unigenes分别有2、5和6个;(2)13个Unigenes均呈现差异表达,大多数呈下调表达趋势,仅有1个Unigenes编码的CTK受体CRE1在24至48h呈上调表达趋势;(3)选择其中2个Unigenes(c60180.graph_c0和c53376.graph_c0)进行荧光定量PCR验证,证实转录组测序结果的可靠性.
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本研究以红脚黄花芥蓝和白花芥蓝Lb07M为亲本,构建了F2和BC1P2分离群体,开花期观察花色并统计各表型的单株数,BC1P2群体白花:黄花符合1∶1分离比,F2群体符合3:1分离比,由此表明这两份材料中白花对黄花为单基因显性遗传.利用简化基因组测序并结合分离群体分组分析法(BSA)找到了芥蓝花色基因关联区段,位于第3号染色体,随后在此区段设计并筛选多态SSR标记,获得4个SSR多态标记,结合表型
本研究用MISA软件对两个姜花转录组中大于1Kb的33373个Unigenes进行SSR位点搜索.在白姜花Hedychium coronarium转录组中搜索到3028个,平均6.9Kb分布一个SSR位点,红姜花H.coccineum转录组中搜索到6840个,平均6.4Kb分布一个SSR位点,两个转录组的优势基序类型均为A/T,GA/TC.对40个长于20bp的SSR位点设计引物,以白姜花和红姜花
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