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新中国成立后，特别是改革开放以来，在党的民族政策的正确指引下，在各级政府和有关部门的重视和支持下，蒙医药事业进入了健康，快速，稳定发展的新阶段。
于1958年蒙医药事业开始走向高等教育的崭新道路，接束了家传教育方式，逐步走向现代化，于2005年与北京中医药大学联合培养蒙医文献专业博士研究生。并在蒙医教学、医疗、科研等方面都取得了令人瞩目的成绩。本文简单介绍了中国内蒙古医学院和蒙古国毛诺斯药学院的"蒙医基础理论"教学与科研进展概况。为今后的蒙医学基础理论的科学研究及教学改革作参考。