【摘 要】
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为给后续柿属植物叶绿体基因工程研究提供基础，利用codonW、CUSP、SPSS软件对5个柿属植物叶绿体基因组中的55条蛋白质编码基因序列进行密码子使用模式分析.结果显示，柿属植
【机 构】
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中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室,湖南长沙410004
【出 处】
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中国林学会经济林分会2016年学术年会
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为给后续柿属植物叶绿体基因工程研究提供基础，利用codonW、CUSP、SPSS软件对5个柿属植物叶绿体基因组中的55条蛋白质编码基因序列进行密码子使用模式分析.结果显示，柿属植物叶绿体基因组密码子第3位碱基GC含量为26.9％～27.8％，有效密码子数在49.58～50.18之间，密码子偏好性较弱；柿叶绿体基因组不同位置的有效密码子数不同，取值范围为32.36～59.64；中性绘图分析和ENC-plot绘图分析结果表明，柿叶绿体基因组的密码子偏好性主要受选择的影响；通过高频密码子和高表达优越密码子分析相结合的方法，筛选出23个柿属植物最优密码子，且这些密码子主要以A和U碱基结尾.
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