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目的：分析自费与享受城镇职工基本医疗保险的慢性病患者的住院费用水平及其医疗保险补偿程度，为制定慢性病医疗保险政策和住院费用标准提供依据。方法：用Kolmogorov-Smimov Z法和Kruskal-wallis H法进行不同人群慢性病住院费用比较，并用回归分析方法确定慢性病住院费用的主要影响因素。结果：医保患者和自费患者的住院费用构成无明显差异，检查费、药品费构成比最大;住院天数、医院等级、是否手术等因素影响慢性病住院费用。结论降低慢性病患者的药品费、检查费、住院天数，制定科学合理的慢性病医疗保险支付政策能明显降低慢性病患者的疾病经济负担。