正常猪外周血淋巴细胞cDNA文库部分EST序列的电子克隆及实验验证

来源 :中国微生物学会第十三届微生物学教学和科研及成果产业化研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wobushilaji
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  本研究应用电子克隆技术和生物信息库对来自正常猪外周血淋巴细胞cDNA文库测序所得的部分EST序列进行了分析和克隆,得到20条片段重叠群(contigs)并进行了基因注释,证实它们均得到了有效延伸,具有完整开放阅读框,其中已知的猪基因序列14条,猪新基因序列6条,从已知猪基因序列和未知猪新基因序列中各抽取l条感兴趣序列进行全长cDNA的预测,EST contigll0和ESTcontig133,设计特异引物进行克隆与测序验证,结果与电子克隆所得序列一致,证实了电子克隆的有效性。还对一个猪新基因-60S核糖体蛋白L18a亚基,进行了理化性质、疏水性和二级结构的初步预测,具有重要研究价值。
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