【摘 要】
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[目的]探究泽兰实蝇幼虫肠道细菌的多样性。[方法]利用16S rDNA技术获得泽兰实蝇幼虫肠道细菌的16S rDNA-V6变异区序列,应用Illumina HiSeq技术测序,应用USEARCH和QIIME
【机 构】
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云南农业大学植物保护学院,昆明650201中国林业科学研究院资源昆虫研究所,昆明650224西南林业大学林学院,昆明650224
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[目的]探究泽兰实蝇幼虫肠道细菌的多样性。[方法]利用16S rDNA技术获得泽兰实蝇幼虫肠道细菌的16S rDNA-V6变异区序列,应用Illumina HiSeq技术测序,应用USEARCH和QIIME等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元(OTUs)数量,分析物种的丰度、分布和A1pha多样性,以及物种丰富度的差异。[结果]共获得1579372个Read数和1571860个OTU数。主要发现了13个门类,4个纲,6个目,7个科,10个属,4个种。其中在属分类阶元上Wolbachia占44％,是优势属；在种分类阶元上Acinetobacter lwoffii占7％,是优势种。 [结论]基于16S rDNA基因文库技术和Illumina HiSeq测序技术分析获得的泽兰实蝇幼虫肠道细菌丰富度高,均匀度高,多样性丰富,为泽兰实蝇肠道细菌的研究提供了更加准确、科学的数据资源。
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