基于Web的猪表达谱基因芯片数据库

来源 :第十五次全国动物遗传育种学术讨论会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sunchine0415
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后基因组时代,基因芯片作为一种先进的、大规模、高通量检测技术,已经广泛用于许多物种的功能基因组学研究。表达谱基因芯片是基因芯片技术中应用得最多的技术之一。然而,农业动物表达谱基因芯片的相关数据共享目前尚不普遍。芯片数据库是解决这一问题的关键。截止目前,本实验室以及其他同行在猪的表达谱基因芯片方面己经积累了很多实验数据,它们都是以原始数据的形式提交到GEO等网站,不利于数据的查询和分析,所以建立猪专门化的表达谱基因芯片数据库很有必要。本研究拟开发一个基于Web的猪表达谱基因芯片数据库,并重点根据基因本体论功能分类(Gene Ontology)、生化代谢与调控路径、基因家族、结构功能域、染色体定位对芯片差异表达探针组进行归类分析。
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