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嗜盐古菌是古菌域中一个独立的进化分支，具有丰富的遗传与代谢多样性。本文首先对嗜盐古菌的特色及其基因组测序工作进行总体介绍，然后重点介绍本实验室近几年在西班牙盐盒菌和地中海富盐菌基因组水平开展的嗜盐古菌遗传与代谢机制的研究，主要包括：嗜盐古菌多复制子及多复制起始位点复制机制的解析；嗜盐古菌真核型基础转录因子和细菌型调控蛋白调控策略的研究；嗜盐古菌合成生物可降解塑料(聚羟基丁酸戊酸共聚酯)的关键基因、关键途径及代谢流分析；以及嗜盐古菌CRISPR-Cas系统的功能与机制等。论文最后还将对嗜盐古菌基因组信息挖掘及在基因组水平对嗜盐古菌生长与代谢进行生物工程编程优化进行简单讨论。