【摘 要】
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目的：通过基于人类全基因组外显子芯片测序技术的全基因组关联分析GWAS,检测口腔癌单核苷酸多态性SNP.方法： 1、采集口腔癌原发灶组织及颈淋巴结转移癌组织,健康志愿者的外周血样本,提取样本DNA并在基因芯片上实施全基因组外显子测序；3、测序后,采用PLINK软件和haploview软件对测序结果进行病例对照组间比较,实现GWAS；结果：在口腔癌组与对照组比较中,经过多重校正共同确定了2个SNP位
【机 构】
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广西医科大学附属口腔医院 广西医科大学口腔医院
【出 处】
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中华口腔医学会第16次全国口腔医学学术会议
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目的：通过基于人类全基因组外显子芯片测序技术的全基因组关联分析GWAS,检测口腔癌单核苷酸多态性SNP.方法： 1、采集口腔癌原发灶组织及颈淋巴结转移癌组织,健康志愿者的外周血样本,提取样本DNA并在基因芯片上实施全基因组外显子测序；3、测序后,采用PLINK软件和haploview软件对测序结果进行病例对照组间比较,实现GWAS；结果：在口腔癌组与对照组比较中,经过多重校正共同确定了2个SNP位点(exm530670代表NM 005514,蛋白质编码基因HLA B；和exm1415896,编码基因C19orf45)与口腔癌相关性结论：HLA B和C19orf45与口腔癌存在紧密关联.
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