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本文通过研究藏马不同类群的遗传多样性,揭示藏马、蒙古马和西南马三个地方品种之间的遗传关系,为探讨中国不同地方马品种的类型划分提供科学依据.结果表明：藏马三个类群存在丰富遗传变异，但藏马群体的遗传分化较低(1.3％);藏马的平均观察杂合度为0.71,与利比赞马数据接近(0.635-0.707,Achmann,2004)。藏马的遗传多样性高于蒙古马和宁强马。蒙古马的遗传多样性下降与近年来政府保护草场政策，大量削减蒙古马数量有关。宁强马的遗传多样性最低，这与它处于濒危保种状态有关。尽管三个地方马品种多态信息含量丰富(PIC>0.6)，但总体遗传分化程度较低(2.1%)，略低于凌英会(2009)对中国23个地方马品种的研究(2.4%)，远低于国外地方品种(如10%的波兰濒危马，Zabk,2005)。