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如何在大型课题中相对保持各分课题的研究特色，是诸课题研究中值得探讨的一个共性问题。本文基于《针灸治疗偏头痛临床实践指南》课题研究中的个性化特色，提出思考。《针灸治疗偏头痛临床实践指南》是国家中医药管理局课题“世界卫生组织西太区循证针灸临床实践指南”的一部分。在研究与编写针灸优势病种偏头痛的循证指南过程中，本课题在总课题组的研究方案框架下，注重突出本课题病种针灸治疗的特点，即个性化的特色。因此，本课题组旨在探索既遵循循证指南方法学“求同”原则，又体现所研究病种的针灸特点的指南制定“存异”过程，冀此以相对保持课题研究中的个性化特色，也可为今后临床其他病种针灸指南的研究制定探索思路。