本文提出一种基于水环境容量的流域生态补偿测算方法，旨在将流域的水质指标作为生态补偿评价的一种手段，并将其纳入到流域和区域综合环境管理的生态补偿机制中，以便探索出一种可行的跨行政区域的生态补偿的测算方法。定义了基于水环境容量的水源地生态补偿的范围、标准和原则等，并以漳卫南流域为例，计算了几个重要水源区生态补偿量，结果表明：安阳市彰武水库饮用水源区上游补偿总额达4.53亿元，直接补偿金1.90亿元;鹤壁市饮用水源区下游补偿总额2.82亿元，直接补偿金1.18亿元;清漳河河北饮用水源区上游生态补偿总额3.88亿元，直接补偿金1.62亿元;岳城水库水源地保护区下游的补偿总额为0.31亿元，直接补偿金为0.13亿元;清漳东源山西保护区下游补偿总额为0.62亿元，直接补偿金0.26亿元。