MALDI—TOF MS—based identification of Salmonel la at species and serotype levels

来源 :第三届传染病防控基础研究与应用技术论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chenww275245962
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
Salmonella can cause illnesses in humans and many animals.Thecurrent diagnostic gold standard used for detecting Salmonella infection ismicrobi010gical culture followed by serological confirmation tests.However,these methods are compl icated and time—consuming.Matrix—assisted laserdesorption/ionization time-of—flight mass spectrometry(MALDI—TOF MS)analysisoffers some advantages in rapid identification,for example,simple and fastsample preparation,fast and automated measurement,and robust and rel iableidentification up to genus and species levels,possibly even to the strain level.In this study,we established a reference database for species identificationusing whole—cel l MALDI—TOF MS:the database consi sted of 12 obtained main spectrafor the Salmonella culture collection strains purchased from the NationaI Centerfor Medical Culture Collection(CMCC)and American Type Culture Collection(ATCC).These 12 Salmonella culture collection strains belong to 7 serotypes.The database was evaluated using 82 clinical isolates of Salmonella,and partial16S rRNA gene sequencing was used as comparision.With regard to theidentification of Salmonella Typhimurium,the accuracy of identification at theserotype level by using MALDI—TOF MS was significantly higher(67.86%)than theaccuracy of identification by using partial 16S rRNA gene sequencing(28.57%)(X2=8.654,P<0.05):nevertheless,there was no significant differencebetween the accuracy of species—level identification by the 2 methods(96.34%and 100%,respectively)(x2=1.358:P>0.05).This study confirmed the highdiscriminatory ability of MALDI—TOF MS for serotype—level identification ofSalmonella.
其他文献
目的:了解中国南部地区人群对手足口病的认知情况,为有效防控手足口病提供科学依据。方法:使用自行设计的“手足口病防治调查与宣传问卷”,选取湖北鄂州、浙江宁波、河南商丘三地的相关人群为调查对象,进行现场知识调查。收集结果后,利用SPSS 13.0统计软件进行数据处理。结果:在选取的三地人群中,宁波地区人群对手足口病相关知识认知情况最好;医护人员较农村人群、城市居民、托幼机构人员认知情况好。三地一般人群
目的:采用优化反应体系的RAPD技术,研究粪类圆线虫的全基因组DNA的分子遗传流行病多态性。方法:提取10例感染粪类圆线虫临床标本全基因组DNA,进行RAPD遗传标记和指纹图谱分析。结果:引物OPA-02和OPC-05均能扩增出多态性丰富的RAPD产物,4、5和6号分离株,以及7、8和10号分离株2种随机引物扩增出的条带均基本一致,随机引物OPC-05从各分离株均扩增到约800bp的产物。结论:1
近些年,随着生物技术的迅猛发展,安全有效的儿童疫苗也不断增多,研发更复杂的联合疫苗的尝试和努力也在逐步加大。当前绝大多数儿童用联合疫苗均起始于百日咳、白喉和破伤风联合疫苗,并逐步加入其他种类疫苗。本文就国内外百白破疫苗为基础的联合疫苗的研究进展进行概述。
目的:建立一种体内外用于精确评价与筛选抗汉坦病毒药物的方法。方法:以汉坦病毒S基因,哺乳动物和鼠甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)基因的保守序列为靶序列,利用Primer Express v3.0软件设计三对实时定量PCR引物,建立了汉坦病毒的SYBR Green实时定量PCR检测方法,并将其应用到抗汉坦病毒药物的评价与筛选中。结果:将汉坦病毒,哺乳动物和鼠GAPDH靶基因连接pGEM—T载体,
目的:收集分析吸毒人员死者原因,为降低吸毒人群死亡率后续活动提供依据。方法:云南省13县及广西5县为调查点,立意抽样回顾问卷调查,通过已亡吸毒人员亲人朋友收集三年内已故吸毒人口学信息、死亡原因等,Epidata建立数据库,SPSS17.0统计学分析。结果:本调查共调查了188名,男性83.3%;84.9%汉族;44.5%单身,59.9%待业或无业;最小18岁,最大51岁,(37.4±5.8),55
目的:了解成都市2010年人群甲型H1N1流感抗体水平,回顾分析人群在甲流暴发期的感染状况。方法:选择成都市6个地区各年龄组共404人作为人群抗体水平监测对象,采用血凝抑制方法测定HI抗体。结果:404人中抗体阳性者123人,阳性率为30.44%,几何平均滴度(GMT)为1:7.54,各监测对象组中不同性别人群HI抗体阳性率无统计学差异,不同圈层人群的HI抗体阳性率差异有统计学意义。12~17岁组
目的:探索影响跨境越南籍暗娼性病艾滋病感染的潜在危险因素,为深化跨境合作提供依据。方法:云南河口县两个固定场所越南籍暗娼为对象,普查方式问卷调查结合深入访谈,收集人口学特征、高危性行为,妈咪、嫖客、语言及同伴等影响高危性行为发生的相关因素。结果:越南籍跨境暗娼艾滋病感染率高达5.9%,性病感染率31.6%。与客人不用安全套主要因为客人不愿使用或者是妈咪阻止使用安全套。同时,语言障碍,暗娼同伴群体中
目的:调查掇刀区2011年4月3日某餐馆中餐15人疑似食物中毒事件,为有效控制类似食物中毒事件的发生,必须加强卫生监督防范管理,采取食物中毒事故应急措施。方法:严格执行《行政处罚法》和《食品卫生法》,调查和处理对象包括中毒病人、中毒食品和造成中毒责任人等。结果:2011年4月3日报告某餐馆15人疑似食物中毒,经调查某餐馆中餐共接待62人就餐,食用牛肝菌菜有15人,疑似食物中毒15人(男8人、女7人
为分析El Tor霍乱弧菌双精氨酸转运(Tat)系统的基因簇构成,确定其最小功能单位。通过与大肠杆菌Tat基因簇的基因同源性比较,推测对霍乱国际测序标准株N16961的Tat系统基因簇的构成;分别对霍乱弧菌Tat系统的基因簇进行单基因缺失、双基因缺失和全基因缺失,建立缺失株和回补株,并与野生株的表型进行比较,进一步分析霍乱弧菌Tat转运系统的基因构成和最小功能单位。霍乱弧菌Tat系统基因簇由tat
目的:利用天津市某区2008—2011年手足口病疫情资料,进行流行病学特点和相关因素分析,为手足口病预防控制工作提供科学依据。方法:资料来自中国疾病监测信息报告管理系统,采用描述性和分析性流行病学和统计学方法对某区2008—2011年手足口病疫情资料进行分析。结果:2008—2011年某区手足口病的发病率从116.2l/10万上升到269.47/10万,2010年最高为299.17/10万。各年均