海流与海洋中的物质循环、初级生产力以及微生物长距离扩散紧密联系,可显著影响微生物多样性与空间分布。真菌广泛分布于海洋环境,在海洋营养物质再循环过程中发挥重要作用。东中国海海流系统复杂,主要由沿岸流、黑潮和混合流组成。基于海流与入海河流的双重影响,东中国海为研究海流如何塑造微生物多样性与群落组成提供绝佳的实验场所。作者采用水温、盐度两个指标精确划分该区域不同海流,采用ITS2 rDNA宏标记技术研究了真菌群落的空间分布及影响因素。本研究揭示该海域拥有高水平真菌多样性,发现接近9千个可操作分类单元(OTUs),隶属真菌界5个门、25个纲、102个目和694个属。海流对真菌群落组成有显著影响,典型的陆地/淡水真菌丝衣霉属(Byssochlamys)在沿岸流中占绝对优势,其数量占比随离岸距离增大而减少;而曲霉属(Aspergillus)在开放海域海流(黑潮、台湾暖流)中占绝对优势,越靠近沿岸则占比越少。统计学分析表明,海流系统、溶解氧和水深是塑造真菌群落组成的重要因素。本研究首次清晰刻画了东中国海海域真菌多样性,并提出受海流与入海河流驱动的真菌被动扩散及海流自身水温差异,共同导致该海域特殊的真菌群落组成与空间分布特点。