本文讨论了李时珍的两肾之间为命门及鼻为命门之窍的倡说。指出其理论源于道家的内功学派。肾间命门论一向视为明赵养葵所创立，其实李说早赵说约半个多世纪。鼻为命门之窍说丰富了脏象理论。肾间命门说己明确地阐明了命门的解剖、生理、病理、药治等诸方面的内容，鼻为命门之窍也有一定的临床指导价值，其理论体系己粗树规模。命门元气作用于丹田，是内气形成的基础，统一了气功学说中前后丹田以及下丹田位置的歧说，故在气功理论上也有它特殊的贡献。今人研究命门有以下丘脑-垂体-及相关的肾上腺皮质、性腺等功能状态为说（《中医年鉴》1983年，268页），若以命门阳气在人体脏器的作用方面言之或可当之：若仅以此认识命门元气在气功方面的重要作用与内气形成的复杂机理，恐远远尚未揭示其微观内涵。因此，李时珍的命门说为人们提供了深入探讨的科研课题。