蓝藻水华形成过程中，蓝藻优势的确立不仅是数量上的，而且形态和生理上也发生了相应的变化。本文针对蓝藻水华主要藻种铜绿微囊藻群体形成前后光化学响应、光化学参数以及生化组成、形态、微结构等的变化进行了分析。结果显示微囊藻形成群体后，在恢复光照和增加光强过程中最大光合作用量子产量(Fv/Fm)显著高于单细胞微囊藻，表明群体微囊藻具有更强的光合作用能力。而且群体微囊藻的非光化学淬灭值显著高于单细胞微囊藻，表明群体微囊藻可以耗散更多的过剩光能，即具有更强的耐受强光的能力。通过光响应曲线参数分析发现：群体微囊藻半饱和光强显著高于单细胞，表明单细胞微囊藻在较低的光强下就能达到光饱和，而群体则需要更高的光强才能达到光饱和，这可能和群体微囊藻具有更高的色素含量有关，这也间接表明群体微囊藻能够耐受更高的光强。最大电子传递速率的升高表明两种藻的光合作用能力均显著升高，但相对而言群体微囊藻在强光下具有更强的光合作用能力。微囊藻群体形成后其生化组成及形态发生明显变化，其叶绿素、藻蓝素、多糖等均显著增加(p<0.05)，这可能是微囊藻光合作用能力以及耐强光能力增加的原因。另外群体微囊藻其内部出现气泡，脂滴减少，这使其浮力增加，这种上浮能力使得微囊藻具有更多的机会利用光能。总之，微囊藻群体形成过程中可能通过生化组成、形态以及微结构的改变，增加了光合作用能力和耐受强光的能力，从而在同其他藻的竞争生长过程中逐步占据优势，从而形成水华。