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结合了TMD模拟和伞状取样的方法在PMF计算中的应用
结合了TMD模拟和伞状取样的方法在PMF计算中的应用
来源 :中国化学会第30届学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tlljs
【摘 要】
:
平均力势通常被描述为特定反应坐标的函数,是一种较为准确的自由能计算方法。目前,靶向分子动力学(TMD)模拟和伞状取样(US)方法相结合的方法被应用于丁烷分子的周期性转动
【作 者】
:
王晴
薛托
宋春年
王艳
陈光巨
【机 构】
:
北京师范大学化学学院,北京市海淀区新街口外大街19号,100875
【出 处】
:
中国化学会第30届学术年会
【发表日期】
:
2016年期
【关键词】
:
TMD
模拟
取样
计算方法
PMF
平均力势
分子动力学
绒毛蛋白
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平均力势通常被描述为特定反应坐标的函数,是一种较为准确的自由能计算方法。目前,靶向分子动力学(TMD)模拟和伞状取样(US)方法相结合的方法被应用于丁烷分子的周期性转动以及绒毛蛋白头部域的展开这两种变构过程的平均力势计算当中。
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