目的全基因组关联研究表明,遗传变异与肿瘤的发生和进展密切相关。本研究旨在探讨剪接因子的遗传变异与膀胱癌易感性之间的相关性。方法通过GO数据库和TCGA数据库筛选剪接因子基因,利用"千人基因组计划"中的中国人群和日本人群鉴定基因上相应的单核苷酸多态性位点（SNP）。基于膀胱癌GWAS （580例患者和1101例对照）,采用logistic回归模型分析剪接因子基因中候选SNP与膀胱癌风险之间的关系。通过TCGA数据库和GEO数据库,探讨风险SNPs宿主基因在膀胱癌组织中的表达水平。结果RBFOX3 rs978416 G>A与膀胱癌发病风险降低有关(OR=0.72,95%CI=0.62-0.84,P=3.54×10^-5)。分层分析发现RBFOX3 rs978416A等位基因在不吸烟人群起到显著的保护效应并可显著降低患非肌层浸润性及低级别膀胱癌的发病风险。与癌旁组织相比,RBFOX3在膀胱癌组织中的表达水平显著降低,但在RBFOX3高表达组中,肿瘤转移程度高、病理分期高的肿瘤患者所占比例显著高于低表达组,RBFOX3水平与膀胱癌恶性程度的相关分析表明,膀胱癌的恶性程度随着RBFOX3表达水平的增加而升高,提示在膀胱癌中RBFOX3可能有双重作用。结论剪接因子基因RBFOX3 SNP rs978416与膀胱癌发病风险密切相关,其可能作为一种潜在的生物标志物,以提高对膀胱癌高危个体的识别。