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本文介绍了云物理服务器上复合SaaS配置问题的形成和建模。该问题可被归为优化问题，其目的在于使得SaaS基于预估执行时间的性能最优。文中采用了一种基于罚分的遗传算法，该算法的设计中综合考虑了SaaS软件组件的配置和数据的配置。基于所做的实验，本文提出的GA算法对实验中所有的测试问题都能产生一个可行的方案，由此可见该算法具有可扩展性。当云的规模增长，或组件的数目增加时，计算时间将接近于线性增长。