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基因丢失是基因组进化和物种形态变异的动力之一。豆科植物具有不同于其它被子植物的特征，例如花器官结构以及共生固氮。豆科植物中基因丢失事件及其进化生物学意义尚不清楚。我们通过已测序的6个豆科蝶形花亚科植物和34个非豆科植物的全基因组序列比对和共线性分析，发现34个拟南芥基因的直系同源基因在豆科植物中丢失，而这些基因在大部分非豆科被子植物中保留了下来，这些基因被定义为豆科植物特异丢失基因。