盖子区域疏水氨基酸调节脂肪酶T1界面吸附和水解活力的机制研究

来源 :华南理工大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:lyfhua
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
脂肪酶的催化反应需要酶分子快速地吸附在油水界面上。在吸附过程中,脂肪酶“盖子”的打开使得活性中心暴露,底物进入催化口袋。同时,在催化活性中心形成大量的疏水界面和界面识别位点,使得盖子更有利地和油水界面结合。因此,盖子结构中的特定氨基酸排布对脂肪酶的吸附过程、底物选择性和催化活力有着重要意义。脂肪酶T1来源于Geobacillus zalihae菌株,属于脂肪酶I.5家族,具有较高的热稳性,因而在工业界受到广泛。螺旋a6和a7被报道为脂肪酶T1的盖子结构,其中螺旋a6由疏水氨基酸和亲水氨基酸交替排布组成,而螺旋a7主要由疏水氨基酸组成。并且,螺旋a6在界面激活过程中发生了重新组合,并且移动20?的距离。本文为了研究螺旋a6特殊的氨基酸排布对界面吸附和底物结合的作用,采用了定点突变和单分子层技术相结合的方法对盖子结构的疏水氨基酸在催化过程中的作用进行研究。主要研究内容为以下五个方面:一、脂肪酶T1的基因克隆、表达和纯化。从NCBI数据库中获得了脂肪酶T1的全长基因序列并由公司合成。将构建的脂肪酶T1表达载体pET23a-CBD-T1转化到大肠表达菌株E.coli BL21(DE3)中,在20℃、1 mM IPTG条件下诱导表达12小时后获得目的蛋白,釆用载体自带的纤维素结合域CBD标签进行亲和层析纯化,获得高纯度的脂肪酶T1蛋白。二、将单分子层技术和经典乳液法相结合测定脂肪酶底物选择性的方法。将脂肪酶T1和脂肪酶PLA1、RML和HIL作对比,系统地研究脂肪酶T1的底物选择性。将单分子层技术测定脂肪酶动力学的方法,与经典的乳液法测定脂肪酶动力学的方法相比较。研究发现,四种脂肪酶T1、PLA1、RML和HIL在三油酸酰甘油酯单分子膜上都具有较高的脂肪酶酶活,但是只有PLA1在大豆卵磷脂单分子层膜上具有较高的磷脂酶活力,脂肪酶T1、RML和HIL具有较低磷脂酶活力。采用经典的乳液法测定脂肪动力学的结果和LB膜技术测定脂肪酶动力学的结果达成一致。三、脂肪酶T1结构分析和突变点的选择。将脂肪酶T1与I.5家族中脂肪酶进行序列比对和结构分析。结果表明,脂肪酶T1的氨基酸序列和I.5脂肪酶家族中其它脂肪酶具有高的同源性和相似性,其中盖子结构区域的氨基酸序列保持高度一致。在脂肪酶T1的闭合结构和来源于Geobacillus thermocatenulatus脂肪酶BLT2开放结构对比的研究发现,组成盖子a6螺旋的氨基酸发生了重新组合。采用定点突变试剂盒以pET23a-CBD-T1质粒为模板,分别将盖子区域中的疏水氨基酸突变成与其大小相似的亲水性氨基酸(F176Y,F181Y,L183N,A186S,V187N,A190S)。重组表达后,釆用纤维素结合域CBD标签进行亲和层析纯化,经过一步阴离子交换层析方法获得高纯度的脂肪酶T1突变体。四、采用单分子层技术研究了野生型脂肪酶T1及其突变体在大豆卵磷脂-水界面上的吸附动力学。基于Langmuir吸附数学模型,计算获得界面吸附常数、界面解析常数和吸附动态平衡常数。结果表明,在所有的突变体中,F181Y,L183N,A186S,V187N的吸附常数减小,而解析常数(kd)基本不变。所以,这导致了F181Y,L183N,A186S,V187N的吸附平衡常数减小。这些常数进一步推导可得脂肪酶的界面浓度GE*(moles cm-2)、界面酶百分比ΦE*%(mol%)和理论分子面积AE*(?2moles-1)。结果发现,酶吸附到界面的百分比(ΦE*)和界面上酶浓度(GE*)与脂肪酶对PC-水界面吸附的平衡常数(KAds)趋势保持一致。单分子酶在界面上占有的理论面积(AE*)增加。基于以上结论,我们提出一个脂肪酶T1在界面上的吸附模型:在盖子结构的6螺旋中,氨基酸残基F181,L183,A186,V187为非常关键的界面识别位点,并且与疏水界面起锚定作用,与界面的疏水相互作用减弱,影响酶分子在界面上的稳定性,从而影响酶分子在界面上的浓度。五、盖子区域疏水氨基酸影响脂肪酶T1水解活力机制。进一步研究盖子结构中的疏水氨基酸对催化过程产生的影响,并且系统地解释了盖子结构中的疏水氨基酸在催化过程对底物相互结合起到的作用。pNPB浓度对脂肪酶活力的影响的研究发现,脂肪酶T1及其突变体具有典型的“界面激活”现象。采用同源建模的方法建立脂肪酶T1的开放结构发现中突变点没有影响脂肪酶T1的起稳定蛋白的相互作用。釆用Discovery Studio的软件中的柔性对接模块,将小分子底物与脂肪酶的开放结构进行分子对接,发现氨基酸残基Leu183和Val187参与了底物1,2-二月桂酸甘油酯的结合。通过单分子技术测定在1,2-二月桂酸甘油酯上的脂肪酶活力发现,突变体L183N和V187N的水解活力降低。可能是因为氨基酸残基Leu183和Val187在影响界面吸附的同时,也参与了脂肪酶T1与底物的结合。
其他文献
番石榴采摘是其生产作业过程的重要环节,使用机器人采摘可以提高采摘效率、降低成本和改善劳动条件。末端执行器是采摘机器人重要执行部件,它对采摘效率和采摘损伤率都有很大的影响。同时,采摘机构的试验受收获季节、天气和场地等诸多因素限制,从而延长样机开发周期,而虚拟现实技术有助于解决这个问题。为研发番石榴采摘机器人,本文根据农艺采摘要求对其采摘末端执行器进行设计,构建番石榴采摘仿真平台并进行采摘仿真试验,测
自然界中的许多现象可以通过非线性方程来描述.本文基于方程自身的特性,综合使用动力系统的分支方法和Hirota双线性方法并结合极限分析,研究了前人提出的几类重要的非线性方程的行波解及其分支.本文主要的研究工作如下:第一章是绪论,主要介绍研究对象的相关背景、研究现状以及相应的基础知识,并对本文的主要内容做出了简要的叙述.在第二章中,对于著名的广义b方程,我们巧妙地利用分支相图,比较系统地讨论了参数b在
彩色铅笔画绘制是非真实感渲染中的一个重要的研究方向。彩色铅笔画绘制可自动地将一幅自然图像转换为铅笔画的艺术效果,其在电影及社交媒体等领域均有广泛的前景及用途。然而,现有算法生成的彩色铅笔画仍存在一些问题:(1)轮廓线条不够突出,且有缺失;(2)画面细节不够丰富,无法很好地展示出原图的层次感;(3)轮廓颜色与主体颜色不匹配;(4)色调过饱和,且存在整体色调不和谐的情况。根据上述问题,本文提出一种颜色
混沌作为系统复杂性的一种刻画,广泛存在于现实世界中.在有限维空间中,混沌现象与系统的非线性性密切相关,然而当相空间是无穷维时,线性系统也可以产生混沌动力学行为.无穷维线性动力学研究无穷维空间上线性算子及强连续线性算子半群(简称C0-半群)生成的半动力系统的长时间演化过程.特别地,线性算子的超循环性以及各种混沌性质的研究极大地促进了线性混沌理论的发展,为揭示混沌现象的本质提供了新的思路,并广泛应用于
自从上世纪七十年代以来,反应扩散方程的行波理论得到充分的发展.人们发现行波能够很好的描述自然界中的振荡现象和有限速度传播问题,所以它的存在性,唯一性和稳定性等被广泛的研究.在现实世界中,随机因素的干扰是普遍存在的.随着随机理论,特别是随机分析和随机微分方程的发展,将随机因素引入到确定性模型中,可以视为是对确定性模型一个必要的完善.本学位论文主要是对随机Fisher-KPP方程的行波进行研究,主要集
代数超结构理论在1934年由Marty首次提出,它是经典代数结构的推广.上世纪80,90年代,在半群理论的研究背景下,Kepka, Jezec以及Nemec等学者开展了对半超群结构的研究.半超群是最简单的一种代数超结构,它是半群概念的推广.众所周知,同余关系是研究半群的一个重要工具.类似地,在半超群上有(强)正则等价关系.半超群关于其上正则等价关系之商结构为半超群,关于其上强正则等价关系之商结构为
在成都市教育局的统一部署下,"149跨区域教育联盟"于2019年12月成立,在西南大学深度学习研究团队的指导下,对标新时代优质高中教育的新内涵,聚焦于智慧教育生态培育,增强高中优质发展核心力量,有序开展了一系列线上线下活动,构建了联盟智慧管理平台,形成了联盟发展的大数据汇聚与分析体系,凝练了"三师"融合发展的教师专业成长路径,增强了公共危机突发时教育教学的应对能力,为教育优质均衡发展献计献策。
由于在弱光探测、火焰检测、环境监测、光通信、遥控装置和图像传感等方面的应用,有机光探测器越来越受到科研院校和业界的关注。目前有机光探测器的器件结构多数以垂直光伏型(电极距离≈100 nm)为主,虽然响应速度快,但存在暗电流大的问题,影响了光探测器的灵敏度。高性能的有机光探测器需要具备高增益(或EQE)、大的响应度及高的光电流(光化学因素),同时快响应速度及低的暗电流(电学因素)是衡量器件灵敏度的重
嫁接育苗是解决蔬菜生产土传病害的重要手段,嫁接苗愈合是嫁接育苗生产的重要环节,目前嫁接苗愈合成活状态的判断,主要依靠人工观察接穗真叶是否出现,愈合状态判断迟滞,降低了嫁接苗规模化生产时愈合装置的利用效率。对于嫁接苗的规模化生产,提前判断嫁接苗的愈合成活状态,能够提高愈合装置的运转效率,这对嫁接苗高效生产具有重要意义。本文以黄瓜嫁接苗为研究对象,提出利用机器视觉技术对愈合期间的嫁接苗进行连续性的无损