社会生产的每个环节几乎都融入了现代科学技术,并在经济活动中应用广泛。实践证明,高新技术产业的蓬勃发展,不仅能优化经济结构,更有助于提升国家产业的核心竞争力。然而科学技术创新道路极其坎坷,实现产业化过程中要克服诸多不确定性因素,其中金融供给能力与服务水平尤为重要。金融在高新技术产业的快速发展中起到了基础保障的作用,当借助科技力量时更有利于提升自身竞争力,实现回报收益最大化的同时获得资本高速成长。但是就现实层面而言,科技运行体系包罗万象、运行过程非常复杂。尽管我国近年来逐年增加在科技领域的投入,但亦暴露出了很多问题。随着科学技术水平的提升,高投入并不一定能获得较高的科技产出率,因此,怎样通过有限的科技投入实现产出最大化是目前科技金融实践发展面临的重要问题。以2009-2014年全国31省市及2012-2016年安徽省60家高新技术上市企业面板数据为样本,通过DEA静态BBC模型与动态Malmquist指数模型从宏观层面和微观层面对科技金融结合实效进行分析,研究发现:安徽地区与全国平均水平存在差异,处于全国中下游水平,虽然效率在稳步上升,差距缩小,但是在2009-2014年期间一直呈现出规模报酬递减,同时,安徽省在高技术产品出口和技术市场成交上存在着产出不足的问题。微观层面上,企业个体间差异较大,基于国企与民企、依赖型和非依赖型两个对照组发现不同类型的企业融合效率值存在一定的差异性,其中民企、非依赖型企业表现的相对较好。相对于企业的投入冗余程度,企业的产出不足问题更为严重,主要集中在营业收入与企业价值方面。