公司治理问题，关键是降低由于所有权和经营权的分离所带来的代理成本，而资本结构表面揭示的是企业资金的不同来源，但实质上体现了各种资金背后的不同产权主体相互依存、相互作用的关系。合理的资本结构对降低股权代理成本、改善公司治理效率、提高公司业绩有着重要的作用。关于如何降低股权代理成本，主要有两个方面的措施：一方面，增加管理人员的持股比例，从而增加管理者的剩余索取权，这样可以内在地激发管理者的积极性，使管理者利益与股东利益更加趋于一致，从而降低股权代理成本。另一方面是增加债务。债务采用固定利息支付方式，债务的利用可以减少企业的自由现金流量，从而缩小了管理者从事低效投资的选择空间，抑制了管理者的在职消费。本文从实证的角度出发，运用上市公司432个样本的连续三年的数据，从股权结构和债务融资两个方面分析资本结构对股权代理成本的影响，其结果表明：股权结构对股权代理成本的影响不显著，管理者持股比例从理论上分析，应该是可以降低股权代理成本的，但是从我国目前的上市公司来看，因为管理者持股比例偏低，所以对股权代理成本的影响不是特别显著，但是表现出了负相关的关系。说明如果提高管理者的持股比例还是可以降低股权代理成本的；而对于股权集中度，从曲线回归分析的结果来看，是随着股权集中度的增加，股权代理成本先随之增加，而当股权集中度达到50％左右的时候，又随其下降。我们分析这应该与国有股持股比例有关，因为国有股持股比例的平均值为37.19％，在国有股持股比例较高的公司中，大多数国有股是控股股东，这样在公司治理中就形成了所有者的缺位，因此会引起股权代理成本的增加；而当股权集中度达到一定程度的时候，其他的股东就可以与国有股股东形成制衡，来监督管理者，这样有利于降低股权代理成本。债务融资对股权代理成本是显著的，无论是从静态的资产负债率还是从动态的债务融资率来看，增加债务是可以降低股权代理成本的。当然，债务的增加也会引发公司的财务危机，另外，还必须考虑债权代理成本的增加，所以负债也不是越多越好，应该权衡股权代理成本和债权代理成本，使之总和最小。