枇杷(Eriobotrya LindI)核基因组DNA提取方法的改良及其SSR初步分析

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枇杷属蔷薇科(Rosaceae)枇杷属(Eriobotrya),原产我国,栽培品种为普通枇杷(E.japonica)。枇杷是一种亚热带常绿果树,秋萌冬花,春实夏熟,在百果中独具先天四时之气,被誉为独冠时新的佳果珍味。   枇杷幼叶表面的茸毛和内含的多糖和多酚等化合物常常影响基因组DNA提取的质与量,而用SSR分子标记构建枇杷的遗传图谱和基因定位时则需要对大量杂种后代个体进行DNA的提取。为此本实验探讨5种DNA提取方法,并改进了快速提取枇杷基因组DNA的方法,获得高质量基因组DNA。同时分别用以27对和36对适用苹果属扩增的SSR特异引物,对15种枇杷品种和两个杂交组合的90个后代单株进行了PCR扩增;分析了品种扩增片断多态性构建聚类关系树,统计了杂种后代等位性位点差异。结果表明,(1)5种DNA提取方法中,改良CTAB法所提取的DNA具有良好的质量;(2)27对引物15个品种中扩增出33个多态性片段,用NTYST2.0软件进行分析聚为六类;(3)36对引物对两个杂交后代单株分别扩出35个和43个位点,可明确双亲均为纯合位点15个和29个,杂合位点分别为20个和14个,更多的位点有待进一步确定。这些结果为杂种后代群体进一步扩增,构建分子标记遗传图谱和性状分子标记奠定了基础。
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