基于RNA-Seq数据研究水稻发育早期的转录组变化

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植物非休眠的成熟种子在适宜的条件下会萌发并长成植株。种子的萌发是指种子从相对静止的状态经历一系列复杂的生理变化长成营自养的幼苗的过程。萌发会受到多种因素包括环境温度、光照、植物激素等的综合调节,其中低温层积处理会打破种子的休眠促使其萌发,而激素中的赤霉素和脱落酸分别会促进和抑制种子的萌发过程。二代测序技术为研究这一过程提供了更为有效的方法,使得我们能够清楚的了解萌发过程中种子内的动态变化。本文分别选取了浸水培养Oh、0.5h、1h、3h以及5h的水稻种子的胚,利用Illumina测序平台的RNA-S
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马铃薯是目前世界上第四大粮食经济作物。具有产量高、营养丰富、适应性强、经济价值较高等特点,在世界范围内广泛种植。但是各种病毒病和类病毒病的发生,导致了马铃薯种性退化,产生各种病症,极大地限制马铃薯质量与产量的提高。本实验在MS及1/2MS培养基的基础上,通过改变6种碳源(蔗糖、绵白糖、果糖、葡萄糖、麦芽糖、可溶性淀粉)和5种氮源(KNO3, Ca(NO3)2, NH4NO3,(NH4)2SO4,N
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本文主要研究了利用菌草技术栽培紫芝和紫芝菌丝的生物学特性;同时对菌草紫芝子实体不同发育阶段、不同部位和不同栽培料栽培的子实体化学成分含量进行了比较和分析;最后对紫芝多糖的提取与分离纯化进行了初步研究。主要研究结果如下:1、利用一级筛选、二级复筛试验筛选出了紫芝的最适菌草栽培配方:芒萁39%、五节芒39%、麸皮20%、石膏2%、含水量63%。2、本试验研究了紫芝菌丝的固体培养和液体培养条件,结果表明
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转录因子(Transcription factor, TF)也称反式作用因子,是一类能够与基因启动子区域中顺式作用元件、沉默子或增强子发生特异性结合并相互作用,从而激活或者抑制目的基因转录和翻译的DNA结合蛋白。前人研究显示MYB转录因子对应答植物逆境胁迫等有重要作用,甘蔗MYB转录因子的研究并不太多。为此,在导师主持的国家“948’颂目(2010-C21)和国家现代产业技术体系建设专项资金项目的
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种子休眠是指具有活力的种子在适宜的条件下(当限制萌发的因素去除时),暂时的不能萌发的现象。脱落酸和赤霉素在种子的休眠和萌发的过程中起着关键的调控作用。种子休眠的状态不仅受成熟过程中的环境影响,而且在脱粒后受周围环境的影响而持续的变化着。由于休眠在所有主要气候区的高等植物中都存在,适应导致了对不同环境的响应。植物能够通过控制萌发的时间这种适应性来避免不良环境,以达到后期的生长和繁殖的目的。首先,通过
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随着基因组测序技术的飞速发展,植物全基因组测序与分析的工作也在逐步展开中,完成了从模式植物拟南芥,到经济作物水稻,再到其他如玉米等多种植物的基因组研究。但是植物的生命周期比较长,大多为多倍体生物,基因组通常都比较大,基因组的杂合度也比较高,基因组内部还含有大量的重复序列,这些特点都成为了制约植物全基因组测序研究的瓶颈。在二十一世纪的第一个十年中,人们发展了各项测序策略来实现全基因组测序,其中逐步克
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