蛋白质二级结构含量的预测

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该文在总结以往的蛋白质二级结构含量预测方法的基础上,尝试用全息结构活性定量关系(Hologram Quantitative Structure-Activity Relationship)的编码方法、用偏最小二乘算法(Partial Linear Squares)来寻找蛋白质一级序列与二级结构含量之间的关系,进行蛋白质二级结构含量的预测,取得了比较好的结果.在全息结构活性定量关系编码表达的方法中,不仅表达了蛋白质一级结构的序列信息,同时考虑了肽链上相邻氨基酸之间的排列信息.在偏最小二乘算法中,考虑了基于氨基酸疏水性质的氨基酸序列组成和自相关方程,对蛋白质二级结构的含量进行预测.
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