三螺旋RNA在体内有着潜在的作用,参与一系列细胞功能,如转录调控、转录后RNA加工、染色质修饰及DNA修复等,这有助于我们进一步了解它们在基因组生物学和调控方面的潜在应用。然而,带负电荷的三螺旋RNA链间存在静电斥力,稳定性相对较低,这是它们在体内应用的一个关键限制。因此具有识别、结合和稳定三螺旋特定序列的小分子令人感兴趣,鉴于在金属配合物中,钌多吡啶配合物具有易于构建的三维结构和丰富的光物理性质,且用手性钌配合物探测核酸结构是一个活跃的领域。因此,本论文合成并表征了一些金属钌配合物,对它们与三螺旋RNA作用机制及其稳定性调控进行研究。本文分为五个部分:第一章概述了三螺旋核酸的研究进展,金属配合物与三螺旋RNA作用机理,研究方法以及前景与展望。第二章设计了两个手性钌配合物Λ/Δ-1,辅助配体和主配体为bpy与7-CF3-dppz,用光谱学、热变技术与流体力学方法研究了它们与三螺旋RNA作用,表明这两个对映体的结合亲和力相差不大,并以插入模式与三螺旋RNA结合,但稳定作用却不同,可能由于Λ/Δ-1通过不同取向与核酸手性环境作用。第三章合成了两个手性钌配合物Λ/Δ-2,主配体为dppx,并研究了它们与三螺旋RNA的结合作用。光谱测试表明Λ/Δ-2与三螺旋RNA的结合强度仅略有不同,和粘度测试一致。虽然Λ/Δ-2结合强度差异不大,且都是插入结合,但Λ/Δ-2对第三链的稳定作用有显著差异,这可能是Δ-2与三螺旋RNA的立体构型具有较高空间匹配度。第四章设计了三个钌配合物（43）/（35）/rac-3,主配体为ptip,通过光谱测试表明Δ-3与三螺旋RNA结合强度稍大于Λ-3和rac-3。它们对第三链都有一定程度稳定作用,而Δ-3对模板双链的稳定作用随着CRu/CUAU比值增大而增加,Λ-3则呈现去稳定性,rac-3在低浓度时显示去稳定现象,这由于不同结构结合作用不同。第五章设计且表征了两个新型芳烃钌（Ⅱ）配合物Ru1和Ru2。在所用条件下的研究显示它们与三螺旋RNA的结合亲和力无显著差异,且都为插入结合,但稳定作用却不同,Ru1倾向于选择性稳定第三链,而Ru2对双链的稳定性稍强。这可能由于三氟甲基是吸电子基团使电子密度降低,正电荷增多,结合能力提高,辅助配体中芳烃环是疏水的,卤素是离去基团,芳烃环决定了芳烃钌（Ⅱ）配合物的电子分布,影响配合物的稳定性。