农村基层党组织是党在农村全部工作和战斗力的基础。改革开放以来，内蒙古自治区农村发展出现了一系列新情况、新问题，迫切要求基层党组织党建工作的不断创新。本文以马克思主义政党关于农村基层党组织建设理论为指导，通过对马克思主义政党基层党组织的基础性、前沿性、终端性及总揽性等组织特点以及内蒙古自治区农村基层党建工作所处民族地区、边疆地区和欠发达地区的特殊环境及其影响研究。分析农村改革和农村发展对农村基层党建工作创新要求和主要以巴彦淖尔市临河区“双链双推”模式、鄂尔多斯市伊金霍洛旗“四权四责”模式、通辽市开鲁县“532”民主决策监督管理模式、赤峰市阿鲁科尔沁旗村务契约化管理模式、呼伦贝尔市阿荣旗“1+3”村务监督模式、赤峰市敖汉旗“四议三公开两报告一契约”工作模式、包头市土默特右旗“四五六”工作模式具有代表性的农村党建工作模式为主要研究对象，分析它们提出的背景和主要做法，总结归纳出内蒙古自治区农村基层党组织工作创新必须坚持结合本地实际、以实事求是的态度推进工作；必须紧紧围绕党的中心任务、把工作落到实处；必须坚持同群众利益相结合、更好地为群众服务必须坚持改革创新；不断增强组织活力必须坚持以人为本、打造服务型党组织的基本经验，针对内蒙古自治区农村党组织建设工作存在、、党员干部思想观念滞后、对党员教育管理不到位、“两委”班子关系紧张、农工作制度机制不适应、服务群众能力不到位的主要问题，从主客观两方面进行较为全面地分析，有针对性地提出了加强内蒙古自治区农村基层党建工作创新必须从党员干部观念思想创新、党员干部教育管理手段创新加、强村“两委”班子建设思路创新、农村党组织工作的制度和机制建设创新、打造“三型”农村基层党组织创新等方面提出对策建议。从而促进内蒙古自治区农村基层党组织工作的不断创新，加强和巩固农村基层党组织在农村的核心领导地位。