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目的：测定PTEN、MMP-2和MMP-9在胃肠道间质瘤中的不同表达，从以下几个方面进行探讨：1．其表达情况与胃肠道间质瘤临床病理学特征的关系；2．探讨胃肠道间质瘤组织中PTEN(张力蛋白和辅助蛋白同源、第10号染色体丢失的磷酸酶基因)蛋白和MMP-2、MMP-9(基质金属蛋白酶-2、基质金属蛋白酶-9)的表达和相互关系以及与胃肠道间质瘤生物学行为的关系；3．为预测该肿瘤的侵袭潜能提供理论依据和可能的预测指标，以指导临床的治疗；4．探讨胃肠道间质瘤组织中PTEN和MMP-2、MMP-9与胃肠道间质瘤预后的关系，以进行科学预后预测。方法：选取山东省立医院普外科1995年1月至2001年1月手术切除经病理证实的胃肠道间质瘤54例，蜡块重新切片，采用免疫组织化学方法(S-P法)检测胃肠道间质瘤中PTEN、MMP-2和MMP-9蛋白表达情况，结合临床病理学资料进行统计学处理。结果：1．PTEN、MMP-2和MMP-9在GIST中的阳性表达率分别为72.2％(39／54)、85.2％(46／54)和83.3％(45／54)，其与胃肠道间质瘤的生长方式、肿瘤直径、浸润转移、核分裂数和坏死有关(P＜0.05或P＜0.01)，而与患者的年龄、性别、肿瘤原发部位无关(P＞0.05)；2．PTEN和MMP-9的表达之间有相关关系(r=0.63，P＜0.05)，MMP-2和MMP-9的表达之间有相关关系(r=0.67，P＜0.05)，PTEN和MMP-2的表达之间无相关关系(r=0.21，P＞0.05)。3．患者5年生存率随PTEN表达率的降低呈递减趋势。MMP-2与MMP-9阳性表达组5年生存率分别为49.3％和53.0％，其阴性表达者5年生存率分别为78.5％和83.5％。MMP-2、MMP-9阴性者5年生存率高于MMP-2、MMP-9阳性患者(P＜0.01)，MMP-2、MMP-9阳性和阴性者5年生存率曲线间差异有统计学意义(P＜0.01)。4．Cox比例风险模型进行单因素分析显示，患者的预后与PTEN、MMP-2、MMP-9阳性表达、肿瘤大小、核分裂相数目、肿瘤坏死、周围脏器组织有无侵犯浸润等因素有关(P＜0.05)。多因素分析发现，MMP-2和MMP-9共表达(RR=2.487，P＜0.05)能独立的预测患者的5年生存率。结论：1．PTEN、MMP-2和MMP-9可能与GIST的发生发展有关，可能参与GIST的增殖、转移、浸润；2．MMP-2和MMP-9可能分别通过降解细胞外基质，促进浸润转移；3．PTEN可能通过调控胃肠道间质瘤组织MMP-2、MMP-9表达，抑制胃肠道间质瘤的浸润和转移．影响病人的预后。4．检测PTEN、MMP-2和MMP-9在GIST中的表达有助于恶性程度的评价，能够指导治疗和预后评估。