全国湖泊面积急剧缩小，水质不断下降，湖泊保护形势日益严峻。生态补偿是用经济手段来有效地解决环境保护与利益相关者之间的矛盾，是实现人与自然和谐相处的现实需要。本研究内容包括：生态补偿标准，生态补偿方式，生态补偿考核，生态补偿监测，生态补偿机制建立的意见和建议。　　本论文在许多学者研究成果的基础上，首先从生态补偿源起着手，总结生态补偿的概念及生态补偿的内容；然后根据生态补偿标准衡算的多种方法的优缺点及对现场调研获得的数据与蔡甸区、汉阳区和武汉经济技术开发区提供的资料进行筛选分析，本研究采用生态服务价值法和污染治理成本法进行分别计算。基于后官湖是武汉典型跨界湖泊这个特点，生态服务价值法具有良好的实用性和准确性，但是该方法在确定跨界湖泊水质污染责任界定方面作用并不突出；污染物治理成本法可以有效、有理有据地解决跨界水体污染责任界定问题，但是在核算污染物入湖总量数据准确性有待商榷，考虑到以上两种方法的优缺点，进而采用层次分析法对两法结果进行优化组合，最终得到生态补偿标准。本研究所得结果如下：　　（1）后官湖生态服务总价值为7.15亿元，根据生态服务价值法的建模，得到该法生态补偿标准1290万元；后官湖由于自然因素和人为因素，已是中度营养性湖泊，污染治理成本法以TP、TN削减量与相应污染物交易价格来衡量，其结果为527万。采用层次分析法结合生态服务价值法与污染物治理成本法优点，得到以上两种方法的权重后，最终后官湖生态补偿标准962万元。　　（2）建立生态补偿机制，不仅只包括组织机构，还要建立考核体制、监测机制、信息公开平台，最大限度地使公众行使参与权与监督权。　　（3）“六湖连通”工程将让六湖与汉江、长江连通，让湖水形成活的循环，这是最好的生态修复措施。