一簇新颖细菌的鉴定及其模式菌株的基因组分析

来源 :中国石油大学(华东) | 被引量 : 0次 | 上传用户:chf012183
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
首先,本论文从中国石化青岛炼油化工有限责任公司污水处理厂的活性污泥中分离获得五株细菌,经过16S r DNA序列分析发现,五株菌之间的相似度在98.73-99.93%之间,并与红细菌科(Rhodobacteraceae)辛芳芳(Xinfangfangia)属的相似度最高。随后,本论文通过形态学与生理生化特征、化学指标、系统发育树和遗传学特征五个方面对五株细菌进行了鉴定分析。结果表明,五株细菌符合红细菌科的主要特征,但又与标准菌存在较大差异;在16S r DNA系统树中,五株细菌与X.soil ZQBWT聚类在一起,形成一簇;多相分类结果支持这簇细菌为红细菌科Xinfangfangia属的新颖物种,将DLY26T定为模式菌株,并将其命名为X.petrolearius sp.nov.DLY26T。其次,以模式菌株DLY26T为研究对象,测定了其基因组序列,并对其基因组功能进行了注释。测序结果共获得全长为3,946,889 bp的基因组序列(拼接修正后)和三个质粒(长度分别为240,421 bp、229,223 bp和218,806 bp);通过基因功能预测,共鉴定出4,421个基因,编码区长度为4,118,082 bp,长度占比为88.8%;基因组功能注释显示,DLY26T共有3,203个蛋白具有明确的生物学功能,而且这些蛋白的同源蛋白来源于356个物种,其中与Rhodobacter sp.SW2的同源性最高(19.5%)。最后,通过对模式菌株DLY26T代谢通路的分析发现,该菌株含有的氨基苯甲酸盐降解代谢通路中有新颖性很高的腈水解酶。因此,本论文初步测定了DLY26T在腈类化合物中的生长情况,发现其能够降解多种腈化物,其中对丙烯腈降解效果较好,降解率可达79.4%。这为今后深入挖掘此类腈水解酶奠定了基础。
其他文献
建筑节能一直是人们关注的焦点,在人类社会与自然的可持续发展过程中,建筑的“开源节流”,开发环保节能的制冷、发电技术显得尤为重要。相比于传统的机械制冷,热电制冷系统由于其具有的体积小、质量轻、温度识别精度高、环境友好、无机械噪音、无工质泄漏和不受重力影响等优势,为建筑通风制冷技术新的思路。但由于热电材料发展受限等原因,目前热电制冷系统的制冷效率较低,为改善这个问题,本文对热电热管耦合制冷系统的性能进
在石油勘探、开采、运输、加工的过程中,会经常发生石油泄漏或含油污水进入地表土壤,并通过渗漏进入含水层,严重威胁着地下水环境安全。石油的成分比较复杂,BTEX(苯、甲苯、乙苯、二甲苯)是石油化工行业最常见的基本原料,具有致癌、致畸、致突变的“三致”作用,且不易被降解,其毒性会对人体健康和生态环境造成很大的危害,因此论文选取BTEX作为炼化企业典型石油类污染物,以高岭土作为防渗材料构建低渗透区域对高渗
随着工业化的进步,在人类的生产生活中产生了大量的废水,其中含难降解有机物与重金属的废水成为人类日益关注的焦点。目前针对这些废水的处理方法有化学法,物理法和生物法,其中光催化技术可以利用清洁的太阳光,激发价带,产生光生电子空穴对,产生一系列活性自由基,降解有机污染物,同时光生电子还原废水中的重金属,为水污染问题提供了可行的方案。但是,光催化技术存在着太阳光利用率低,光生电子空穴复合率高的问题,限制了
当今社会,环境污染已经成为制约社会发展和进步的严重障碍,尤其是大气中难以处理的VOCs的处理更是人们亟待解决的问题。近年来,传统的生化处理法和化学处理法已经不能满足当今时代社会发展的需要,而光催化技术具有清洁、无二次污染、可以利用太阳能等优点受到广大研究者的重视。传统的半导体光催化材料的代表——TiO2由于具有较宽的禁带(约为3.2 e V),且其量子效率过于低,限制了其在光催化领域的发展及应用。
基因工程和发酵工程技术的发展,使得重组蛋白质的异源表达成为生产蛋白质药物的重要途径。但是过量表达的蛋白质往往形成包涵体(不具有生物活性的非水溶性蛋白质聚集体),因此包涵体的复性技术成为规模化生产蛋白质的技术难题之一。折叠助剂由于能够促进蛋白质的体外复性,近年来受到了研究者的极大关注。其中,温敏型聚合物N-异丙基丙烯酰胺(N-Isopropyl acrylamide,NIPAM)已被证实是一种有效的
肽核酸(Peptide Nucleic Acid,PNA)是一类人工核酸,其以中性的肽骨架代替了天然DNA中脱氧戊糖磷酸结构。得益于不带电荷的肽骨架,肽核酸可高效识别DNA和RNA,为基因治疗和生物检测提供了新的发展方向,成为了近年来的研究热点。但现有的肽核酸结构中不含有手性,导致其与DNA结合时缺乏指向性,无法与DNA形成专一的反平行结构,限制了其在临床和检测中的进一步应用。近年来国内外多个课题
根据《国务院关于开展第二次全国污染源普查的通知》,2018年第二次全国污染源普查的各项工作正逐步进行中。石油炼制作为石化行业重要的一部分,其污染源的监管仍是我国环境管理的重要核心。对石油炼制行业进行污染源普查,有利于摸清其各类污染源数量、产排污特点、地区分布情况等,也是建立健全重点污染源档案、企业污染源信息数据库和环境统计平台的基础;为制定切实可行的环境保护政策和法规、提高环境监督执法的针对性和有
近年来,全世界死于恶性癌症的患者逐渐增多,而肿瘤致死的原因大多是由恶性肿瘤细胞的转移造成的,由此,对细胞迁移行为的研究就显得尤为重要。本文首先通过聚(N-异丙基丙烯酰胺-苯乙烯)(p NIPAAm St)温敏性微凝胶颗粒的排列密度对细胞黏附、形貌、活跃性和增殖行为进行调控,进而利用微接触印刷的方式制备图案化的微凝胶表面用于对细胞迁移的行为进行探究。细胞的黏附和形貌与材料表面的性质紧密相关,温敏性微
厌氧氨氧化工艺以其经济高效等各方面优势成为当下最热门的废水脱氮技术之一,具有广泛的应用前景。然而该工艺需要以亚硝酸盐作为电子受体,同时脱氮过程还会产生硝酸盐的二次污染问题,一定程度上制约了该工艺的规模化应用。而硫自养反硝化能够以还原性含硫化合物(S~0、S2-、S2O32-)为底物,反硝化NO3-或NO2-为N2,近年来也成为脱氮领域的研究热点之一。依据厌氧氨氧化与硫自养反硝化代谢含氮底物的形式(
阿尔兹海默病(Alzheimer’s disease,AD)的病理学特征之一为淀粉样斑块(老年斑),而淀粉样斑块的主要成分为β淀粉样纤维。淀粉样蛋白级联假说认为β淀粉样蛋白(β-amyloid,Aβ)是导致AD的主要诱因。淀粉样斑块内及周围富集着大量的Cu2+,研究发现Cu2+可以诱导Aβ形成神经毒性较强的寡聚物。因此探究Aβ的聚集行为及Cu2+对Aβ聚集行为的影响对AD的研究具有十分重要的意义。