论文部分内容阅读
鄱阳湖位于江西省北部,是我国第一大淡水湖,湖面以松门山为界分为南、北两部分,南部湖面宽阔,为一主湖区,北部湖面狭长,为湖水入江水道区。鄱阳湖独特的地理环境和气候条件,也使得其微生物多样性非常丰富。本研究通过直接提取取自鄱阳湖南湖主湖区（N29°09′10.06″,E116°04′24.57″）水样NHⅠ、NHⅡ的细菌总DNA为模板,以细菌的16SrDNA通用引物PCR扩增鄱阳湖南湖水样中细菌的16SrRNA基因,构建16SrDNA克隆文库,经限制性内切酶片段长度多态性（Restriction Fragment LengthPolymorphisma,RFLP）分析,DNA序列的测定和系统发育分析等,对鄱阳湖南湖主湖区细菌多样性进行了研究。研究结果表明:（1）鄱阳湖南湖主湖区2006年10月取的水样（NHⅠ）中的细菌包括了变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、疣微菌门（Verrucomicrobia）、拟杆菌门（Bacteroidetes）四大类群和10个尚不能确定分类地位的基因型。其中变形细菌、拟杆菌和放线菌是优势类群,分别占47.2%、18.9%和11.3%。（2）鄱阳湖南湖主湖区2007年5月取的水样（NHⅡ）中的细菌包括了变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、蓝细菌门（Cyanobacteria）、疣微菌门（Verrucomicrobia）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、浮霉菌门（Planctomycetes）六大类群和8个尚不能确定分类地位的基因型。其中变形细菌、拟杆菌和放线菌是优势类群,分别占59.0%、9.8%和8.2%。（3）获得的细菌文库克隆子序列90%以上与Genbank中已知序列相似度≥97%,说明鄱阳湖南湖主湖区中的细菌物种分布很广泛,多数已在对其它环境样品的研究中被发现。（4）对两次取样的两个克隆文库的统计学分析发现,库容Coverage C、Rarefaction曲线、仙农指数Shannon-Wiener index（H’）和SChaol值四个指数都一致表明鄱阳湖南湖主湖区细菌多样性非常丰富。（5）将两次研究结果比较发现样品NHⅡ中的细菌多样性要高于样品NHⅠ中的细菌多样性,表明鄱阳湖南湖主湖区细菌多样性随季节的变化而变化。（6）将本研究结果与本实验室对鄱阳湖北湖的研究结果比较,发现鄱阳湖南湖的细菌多样性要高于鄱阳湖北湖。