随着经济体制改革的不断深化,我国科研事业单位遇到了与市场经济体制不相适应的种种问题。自上世纪80年代初事业单位试行企业化管理以来,尽管事业单位的财会工作按照企业化要求作了许多改进,有了很大转变,但对财会工作的重视程度仍不够,这种状况对事业单位改制是不利的。国务院针对科研事业单位转制作了许多工作。已有200多家科研院所转为科技企业,按企业化运行机制运行。这是科技体制改革以来最大的改革,即单位的性质发生了根本的变化,由事业单位管理体制转化为企业管理体制。大多数科研事业单位将按照国家有关政策改制后走向市场,从非营利性组织逐步转变为以市场为导向的营利性主体,这对一向以事业单位财务管理为主的科研院所提出了很大的挑战。在这一历史性的转制过程中,我国科研事业单位财务管理中存在许多问题亟需解决。故在本文中主要就财务管理问题进行研究,分析存在的相关问题,研究提出解决方法,制定转制完成后的内部会计控制制度等。本文依托科研事业单位转制这一背景,站在企业管理者的角度,探讨科研事业单位转制面临的财务管理问题,以使转制的科研事业单位的财务管理更好地服务于转制后企业的发展。论文包括四个部分:第一部分简要介绍科研事业单位转制财务问题研究的背景、研究的目的、研究内容、重点及研究方法;第二部分论述事业单位转企业单位的依据,包括理论方面的依据、现实依据、政策依据以及我国事业单位转制进展情况;第三部分研究分析科研事业单位转制中存在的主要财务管理问题,并研究提出相关对策;第四部分对案例单位ZG建筑科研所的转制情况及其转制碰到的财务问题处理进行了案例分析。