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目的探讨3-甲基腺嘌呤（3-methyladenine,3-MA）和氯喹（Chloroquine,CQ）对脑缺血再灌注（cerebral ischemia reperfusion,CIR）大鼠脑细胞自噬、凋亡和坏死的影响,并研究其相关因子（Atg5、Atg7、Atg16L1、Beclin1、LC3、Caspase3、Caspase9、PARP1、PI3K、TGF-β、TNF-ɑ）的变化。方法健康SD大鼠被分为假手术组（Sham）,脑缺血再灌注模型组（Model）,3-MA组和CQ组,每组16只大鼠。各组均采用侧脑室注射给药,除Sham组外,其余各组均应用线栓法使右脑中动脉栓塞（middle cerebral artery occlusion,MCAO）制成缺血2h,再灌注24h模型,3-MA组和CQ组分别给予3-MA 55μg,CQ 0.6mg·kg-1。然后各组均采用神经功能缺损评分、TTC染色、脑含水量以判断模型是否制作成功,透射电镜观察海马区的细胞死亡情况,采用TUNEL染色检测细胞凋亡,采用HE染色观察细胞坏死,采用ELISA检测TGF-β、TNF-ɑ的水平,采用免疫印迹法检测自噬Atg5、Atg7、Atg16L1、Beclin1、LC3、Caspase3、Caspase9、PARP1、PI3K和免疫荧光技术检测Beclin1、Caspase3、Caspase9、PARP1的蛋白表达。结果神经功能缺损评分,Sham组0分,其他各组1-3分不等;TTC染色显示:除Sham组外,其他各组模型制作均成功;脑含水量,3-MA组最高,Sham组最低。透射电镜显示:Sham组呈现少量凋亡和自噬外,其他各组均有不等量的自噬、凋亡和坏死标志物形成。TUNEL染色显示:除sham组有少量凋亡,其它各组凋亡细胞均明显增多,其中以Model组最高。HE染色显示:除Sham组外,其他各组均有坏死发生,其中以3-MA组最高。ELISA检测显示:TGF-β以Model组最高,TNF-ɑ以3-MA组最高。免疫印迹法和免疫荧光显示:Sham组自噬及凋亡相关因子处于较低水平,Model组表达最高（P<0.05）,CQ组次之,3-MA组基本上最低。结论脑缺血再灌注大鼠中,用3-MA抑制自噬,其可能通过高表达TNF-α而抑制Caspases基因的表达,使脑细胞凋亡稍改善,而坏死情况明显增加,脑梗死面积增大;而用氯喹抑制自噬,其可能通过稍降低Caspases表达而使脑细胞凋亡和坏死情况有所改善,脑梗死面积减小。