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[目的]
分析粤西地区汉族人群Sirtuin2基因内含子区rs7257949A/T、rs11667030C/T、下游非编码区G+281A(rs2241703)单核苷酸多态性(SNPs)频率分布特点,并探讨其与帕金森病(PD)的关系。
[方法]
采用病例-对照研究,选择粤两地区汉族人群中83例PD病人(病例组)和103例健康体检者(对照组)为对象,应用聚合酶链反应-限制性酶切片段长度多态性分析方法(PCR-RFLP)检测Sirtuin2基因SNP rs7257949A/T、rs11667030C/T、rs2241703G/A,用DNA测序方法印证基因分型,并分析其基因型及等位基因频率在正常人群及PD患者中的分布特点。
[结果]
1.Sirtuin2基因SNPrs7257949A/T位点多态性,病例组A、T等位基因频率分别为48.6%(70/144)、51.4%(74/144),对照组A、T等位基因频率分别为34.0%(70/206)、66.0%(136/206),经x2检验两组之间的差别有统计学意义(x2=7.559,P=0.006);病例组AA基因型20.7%(17/82),T等位基因携带者为79.3%(65/82),而对照组分别为AA型7.8%(8/103),T等位基因携带者为92.2%(95/103),经x2检验两组之间的差别有统计学意义(x2=6.566,P=0.010)。
2.Sirtuin2基因SNPrs11667030C/T在病例组中TT基因型频率26.5%(22/82),对照组为35.6%(37/104),差异无统计学意义(x2=1.620,P=0.210);病例组T等位基因频率为54.3%(89/164),对照组为57.2%(119/208),其差异无统计学意义(x2=0.322,P=0.570)。
3.Sirtuin2基因SNPrs2241703G/A在病例组中A等位基因频率以及GA+AA基因型频率高于对照组,两组差异无统计学意义(P>0.05);经性别分层分析发现,在女性中PD组A等位基因的频率及GA+AA基因型频率较对照高,经x2检验提示其差别有相关倾向(x2=2.716,P=0.099;x2=3.205,P=0.073);PD组出现两例AA基因型,而对照组则无此种基因型。
4.对Sirtuin2 SNPrs7257949A/T、rs2241703G/A位点进行连锁不均衡性(linkagedise-quilibrium,LD)和单倍体型分析,D,=0.463,r2=0.066。4种单倍体型在病例组与对照组人群之间均无统计学意义。单倍体型TG单倍体型在病例组与对照组巾的频率分布差异较大,但未达统计学差异。
5.经DNA测序,结果显示rs7257949A/T、rs2241703G/A两位点多态性与PCR-RFLP方法分型结果一致。
[结论]
1.Sirtuin2基因内含子SNPrs7257949A/T的A等位基因是PD的危险因素:AA可能是PD的遗传易感性基因型。
2.Sirtuin2基因内含子SNPrs11667030C/T与帕金森病发病无关。
3.Sirtuin2基因下游非编码区rs2241703G/A多态性的纯合子AA可能是PD的遗传易感性基因型,而在女性中A等位基因可能是PD的危险因素。
4.Sirtuin2基因SNPrs7257949A/T、rs2241703G/A位点组合的单倍体型中,TG单倍体型可能是PD发病的危险因素。