北京黑猪10个基因的多态性与产仔性状的关联分析

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本试验采用PCR-RFLP和直接电泳的方法分析了北京黑猪群体的FSHβ、ESR、PRLR、BF、Lep、EGF、RBP4、OPN、BMP15和FUT 1共10个候选基因的多态性及其与北京黑猪的产仔性能之间的关联,结果表明:在北京黑猪群体中,FSHβ片段2的HaeⅢ酶切位点、ESR的PvuⅡ酶切位点、PRLR的AluⅠ酶切位点、BF的SmaⅠ酶切位点、Lep的胁HinfⅠ酶切位点、RBP4的MspⅠ酶切位点和FUT1的HhaⅠ酶切位点均检测3种基因型,而BMP15基因的BciT130Ⅰ酶切位点检测到AA和AB两种基因型。在FSHβ片段1的第1内含子和EGF第3内含子上分别存在274bp和876bp的缺失突变,检测到两个等位基因,表现出3种基因型。OPN基因第6内含子在长白猪、大白猪群体中存在307bp的缺失突变,但是北京黑猪只有BB型,不存在多态性。多态信息含量、杂合度和有效等位基因数统计结果表明,FSHβ的2个位点、BF、EGF、BMP15基因的突变位点在北京黑猪群体中均处于低度多态,而ESR、PRLR、LEP、RBP4、FUT1处于中度多态,经x~2适合性检验,除OPN基因外的9个候选基因10个位点的突变(缺失)均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。基因多态性与产仔性状的关联分析结果表明:FSHβ基因2个位点上,AA型个体的TNB(总产仔数)和NBA(产活仔数)高于AB和BB型个体(初产母猪P<0.05,经产母猪P>0.05);ESR基因PvuⅡ位点上,经产母猪的AA和AB基因型个体的TNB和NBA显著的高于BB型个体(P<0.05),其A等位基因表现为正效应;PRLR基因AluⅠ位点上,AA型个体的TNB和NBA高于AB和BB型个体,除了经产母猪TNB差异显著以外,其余的差异均不显著;BF基因SmaⅠ位点上,经产母猪AB型个体的NBA显著的高于AA和BB型个体(P<0.05);Lep基因的HinfⅠ酶切位点和EGF基因的缺失突变位点上,不论是初产还是经产母猪,各基因型个体间的产仔性状无显著差异;RBP4基因MspⅠ位点上,BB型个体的TNB和NBA高于AA和AB型个体(初产母猪P<0.05,经产母猪P>0.05);BMP15基因BciT 130Ⅰ位点上,初产和经产的AA型母猪的NBA和TNB高于AB型个体(P>0.05);FUT1基因HhaⅠ位点上,经产母猪AA型个体的TNB显著的高于GG型个体(P<0.05)。综上结果,FSHβ基因的HaeⅢ酶切位点、FSHβ基因第1内含子274bp的缺失突变、ESR基因的PvuⅡ酶切位点、PRLR基因的AluⅠ酶切位点、BF的SmaⅠ酶切位点、RBP4的MspⅠ酶切位点和FUT1的HhaⅠ酶切位点可作为与北京黑猪产仔性状(NBA和TNB)关联的遗传标记。利用这6个基因的7个位点的标记对北京黑猪群体开展标记辅助选择,有望获得较大的遗传育种进展和经济效益。
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