目的:目前中国人口老龄化问题严重,为了解决老年共病,尤其是心脏和肾脏共病问题,本研究利用临床生物信息学和文本挖掘方法对心肾脏器生克理论进行表观基因组学机制研究,从而对中医心肾相克理论进行解释,进而对临床心病、肾病、心肾交集性疾病等的治疗和诊断提供指导。方法:基于人体正常的基因组学数据库,采用蛋白质互作网络、基因功能聚类分析以及通路关联分析等数据库分析方法,对心脏和肾脏的组学特征进行关联分析,并通过文本挖掘方法对其准确性进行评估。结果:本研究发现了心脏和肾脏交集基因568个,心肾交集性通路40条,制作出心肾交集基因共表达互作网络。钙离子通路中PLN基因在心脏和肾脏中都会高表达,但是与它相邻的SERCA基因、RYR基因及STIM基因在心脏中高表达,而在肾脏中表达倍数比较低。Titin、TnT、MYBPC、MYL2、TPM这几个基因在心脏肥厚型心肌病通路中高表达,肾脏当中则一个都没有,而DHPR、PPKAA、TGF-β这三个基因在心脏和肾脏肥厚型心肌病通路中都会高表达。结论:心肾交集基因共表达互作网络表明了心肾生克具有组学的物质基础,为临床提供了在心脏或肾脏发生疾病的时候,通过调节肾脏或心脏来治疗疾病的新思路。通过对钙离子通路结构及功能的进一步研究,从表观基因组学的层面对中医心肾相克理论做出解释。对肥厚型心肌病通路的关联分析表明心脏和肾脏中PPKAA基因的多态性发生变化时,可能会引起肥厚型心肌病,提示临床大夫在观察到肾病患者肾脏中PPKAA基因的变化,要注意患者发生肥厚型心肌病的风险。